Инсон ҳуқуқлари бўйича Ўзбекистон Республикаси Миллий маркази мамлакатимиз Президентининг 1996 йил 31 октябрдаги Фармонига мувофиқ ташкил этилган эди. Бундан инсон ҳуқуқлари ва эркинликларини муҳофаза қилишнинг таъсирли воситасини барпо этиш, бу борада халқаро ва ҳуқуқни муҳофаза қилиш ташкилотлари билан ҳамкорликни кенгайтириш, давлат муассасалари ходимлари ва барча аҳолининг инсон ҳуқуқлари бўйича маданиятини ошириш мақсадлари кўзланганди. Фармонда таъкидланганидек, Миллий марказ давлатга қарашли, таҳлил, маслаҳат, идоралараро ва мувофиқлаштириш органи ҳисобланади.
Мамлакатда инсон ҳуқуқ ва эркинликларини рағбатлантириш, риоя қилиш ва уларни ҳимоя қилишга йўналтирилган чора-тадбирларни амалга ошириш, миллий маърузалар тайёрлаш, ушбу соҳада давлат органлари ва жамоат бирлашмалари фаолиятини мувофиқлаштириш, қонун ҳужжатлари ижро этилиши мониторингини олиб бориш, фуқаролик жамияти институтлари, жумладан, нодавлат нотижорат ташкилотлар билан мустаҳкам алоқа боғлаш, шунингдек инсон ҳуқуқлари соҳасида халқаро ҳамкорлик қилиш Миллий марказ фаолиятининг асосий йўналишларидир.